省海洋科学研究院首次发布大泷六线鱼染色体水平全基因组序列

近日，我院在鱼类基因组研究领域取得重要进展，首次破译大泷六线鱼染色体水平全基因组序列。相关研究成果以“A Chromosomal-level genome assembly and annotation of fat greenling (Hexagrammos otakii) ”为题，在Nature旗下科学期刊《Scientific Data》上发表。李莉副研究员为文章第一作者，团队负责人胡发文研究员为通讯作者。

　　大泷六线鱼(Hexagrammos otakii)作为我国北方特有的重要海水经济鱼类，肉质细嫩、味道鲜美，素有“北方石斑”之称，是网箱养殖、渔业增殖和休闲渔业的理想品种。2005年以来，我院鱼类团队系统开展了大泷六线鱼人工繁育、增养殖等相关应用基础研究及技术攻关工作，首次攻克其人工繁育重大技术难关，实现苗种规模化生产，有力推动了大泷六线鱼增养殖产业的发展。

　　该研究采用PacBio和Hi-C技术，对大泷六线鱼基因组进行了组装，在国际上首次获得了高质量的染色体水平参考基因组。该基因组大小为682.43 Mb，Contig N50大小为2.39 Mb，Scaffold N50为27.83 Mb。BUSCO评估的基因组完整性为96.99%。总共预测蛋白质编码基因22334个，其中21619个（96.8%）在各种蛋白质数据库中进行了功能注释。该基因组的获得将为大泷六线鱼种群遗传、系统进化、选繁育及资源保护等奠定重要基础。

　　全文链接：https://doi.org/10.1038/s41597-025-04368-3